為了讓科學園區內的動物有地方休息，竹科管理局規劃並保留了大塊的綠地、水池，讓植物生長並且營造動物的家；定期執行動、植物、蝴蝶以及水生生物的調查，藉由記錄牠們的數量及調查到的種類，瞭解園區對環境生態的影響。

新竹園區常調查到的保育類有大冠鷲、鳳頭蒼鷹、黃嘴角鴞及領角鴞，竹南園區則偶有發現黑翅鳶及大冠鷲，在開闊的草地或電線上也能看到保育類－紅尾伯勞，牠的背是紅褐色，腹部呈淡黃褐色，眼睛周圍有明顯的黑色眼袋，叫聲是乾澀的「哧—哧—哧」。

龍潭園區曾發現臺北市市鳥－臺灣藍鵲，牠有紅色嘴巴、金黃色眼睛、黑色頭及藍色身體，如果你在戶外聽見聒噪的「嘎、嘎、嘎」、「地笛—地笛—」或「嘎嘎—穗」等變化多端的叫聲，或許可以找找這位藍色嬌客。

宜蘭園區周圍水田、池畔或農田邊常發現彩鷸，每當進入秋冬期，彩鷸爸爸會帶著彩鷸寶寶在水田間覓食，而且牠們相當害羞，多半躲在隱蔽的草叢中，此外，也可發現具有表演潛力的紅嘴黑鵯，牠的叫聲變化多端，有時會發出貓叫聲「喵~喵」，有時也會發出「小氣鬼」逗趣的聲音，在有果樹的地方很容易發現牠們喔。

銅鑼園區的天空常有大冠鷲、鳳頭蒼鷹、東方蜂鷹、紅隼等保育類鳥類在天空翱翔，而在樹林間也常發現紅尾伯勞、五色鳥、臺灣畫眉、臺灣藍鵲的蹤影，臺灣畫眉更有是寶島歌王之稱，有機會來聽聽牠們婉轉悅耳的聲音吧！在夜間可利用紅外線照相設備來紀錄動物們的活動，你們看麝香貓在鏡頭下的閃亮眼睛是不是很可愛!

生醫園區內的樹上常可看到尾巴長長的樹鵲，叫聲是「嘎、嘎、嘎、嘎」令人覺得吵雜的聒噪聲；草地上則有認真找食物的黃頭鷺；躲在樹林間敲著木魚，發出「郭、郭、郭」的花和尚-五色鳥，還有叫聲豐富變化、全身黑色羽毛的紅嘴黑鵯。

更新日期：2024-03-01